Obs De Minzerie maakt onderdeel uit van een overkoepelende stichting Fluvium die het bestuur vormt van 15 openbare scholen van de gemeente Geldermalsen en Neerijnen. De MR van alle verbonden scholen hebben zitting in de Gemeenschappelijke Medezeggenschapsraad (GMR). Van iedere school heeft een lid van de oudergeleding en een lid van de personeelsgeleding zitting in de GMR. De GMR bespreekt de belangrijke zaken van de stichting met de directie van de stichting Fluvium. Hier gaat het bijvoorbeeld over de meerjarenbegroting van de stichting, integraal personeelsbeleid of een bovenschools ICT beleidsplan.